71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0744 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 339 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 329 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  29.2 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  35.44 
 
 		 588 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  53.97 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2902  hypothetical protein  29.01 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6382  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.980358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  39.78 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  31 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  33.51 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  51.67 
 
 		 586 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  34.55 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 411 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 227 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 191 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 377 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  44 
 
 		 275 aa  52.8  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  24.14 
 
 		 374 aa  52.8  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  25.82 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 398 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 402 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  40.62 
 
 		 388 aa  50.4  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 369 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 381 aa  49.7  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 187 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  30.28 
 
 		 188 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 379 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  37.5 
 
 		 839 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  50.77 
 
 		 388 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 207 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 303 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 367 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  50.77 
 
 		 388 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  28.47 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  28.47 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 385 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 370 aa  43.9  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 		 222 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 998 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  39.66 
 
 		 373 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  38.36 
 
 		 377 aa  42.7  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>