106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6379 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 380 aa  763    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 378 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 379 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  26.91 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 381 aa  89.7  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 381 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  24.94 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  25.69 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  23.58 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  31.16 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  28.3 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  28.1 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  30.62 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  26.74 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  26.09 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  24.05 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  27.85 
 
 		 370 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  27.74 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  23.28 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  24.47 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  22.83 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  29.86 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  21.05 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 586 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  27.27 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  28.38 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  28.38 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  21.85 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  24.37 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  28.42 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  23.36 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  39.56 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  24.01 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  45.59 
 
 		 187 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 191 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 191 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 588 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 321 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  44.62 
 
 		 388 aa  53.1  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  24.55 
 
 		 392 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 188 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  30.65 
 
 		 339 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  26.32 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  22.38 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  24.05 
 
 		 365 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  24.93 
 
 		 368 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3945  regulatory protein, LuxR  32.04 
 
 		 191 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 151 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.83 
 
 		 894 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6272  transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 		 275 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 215 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 226 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 368 aa  47  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  24.89 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0504  transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0705101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  24.48 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 227 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.33 
 
 		 536 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7042  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 237 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0302  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 227 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  31.4 
 
 		 955 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 894 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 219 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  34.85 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4266  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 		 330 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>