More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2318 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  303  7e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  42.75 
 
 		 356 aa  96.3  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 359 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  37.33 
 
 		 376 aa  92.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 374 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 368 aa  87.8  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  46.94 
 
 		 376 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  45.92 
 
 		 374 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 372 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 347 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  38.61 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  33.61 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  37 
 
 		 324 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  40.86 
 
 		 344 aa  63.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3500  LuxR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 363 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3378  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 249 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.394495  normal  0.0844825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0321  transcriptional regulator, LuxR family  51.56 
 
 		 524 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0520  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.1412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2357  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  36.94 
 
 		 378 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1438  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 367 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017227  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0406  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 486 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0269651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  46.55 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0606  transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 506 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 221 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 799 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3287  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0842926  normal  0.330639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3767  regulatory protein, LuxR  45.28 
 
 		 89 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.163758 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3397  two component LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 328 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.67 
 
 		 217 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 204 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  43.1 
 
 		 337 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 258 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 910 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3475  response regulator receiver  31.52 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 227 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6272  transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 394 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 222 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 904 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1613  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0395666  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 814 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0618  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 215 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7843  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 231 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176081 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 320 aa  51.2  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3468  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 248 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0530935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3373  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 227 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 214 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 228 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 435 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 213 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3366  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 227 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.857101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3299  LysR-family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 227 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 755 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 228 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3294  LysR-family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 248 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42203  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  49.06 
 
 		 893 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0597  transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 493 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.882562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 306 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 235 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 197 aa  50.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1181  response regulator, positive activator of uhpT transcription  35 
 
 		 318 aa  50.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041551  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 223 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7171  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 339 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 954 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 214 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1520  LuxR transcriptional regulator  39.62 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 223 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.28 
 
 		 913 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  41.1 
 
 		 943 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.86 
 
 		 217 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 232 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6405  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 881 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5188  two component response regulator  44 
 
 		 220 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  49.09 
 
 		 903 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 881 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 333 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1249  response regulator  44 
 
 		 245 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0947405  normal  0.0892263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 876 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3265  transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  28.68 
 
 		 879 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1837  transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 487 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>