95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0385 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  100 
 
 
378 aa  761    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  52.22 
 
 
379 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
395 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  25.85 
 
 
395 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  24.93 
 
 
378 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  25.61 
 
 
377 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
381 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
383 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  27.2 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  22.43 
 
 
405 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  22.75 
 
 
370 aa  94.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
362 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
398 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 
385 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  24.41 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
380 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  32.02 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  23.5 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  22.62 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  25.86 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  24.8 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  24.4 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  25.53 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  24.91 
 
 
397 aa  77  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  25.07 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  26.29 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  25.07 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  24.8 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  21.76 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  28.28 
 
 
375 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  29.09 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  25.07 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  25.67 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  29.72 
 
 
370 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  25.07 
 
 
372 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  26.77 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  26.77 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  25.95 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  24.39 
 
 
367 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  23.59 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  28.26 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 
417 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 
417 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  33 
 
 
229 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  23.96 
 
 
374 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  35.71 
 
 
275 aa  60.1  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  27.34 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  26.64 
 
 
374 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
191 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
191 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  52.54 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 
586 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  29.13 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
378 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  27.63 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  33.6 
 
 
370 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 
187 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  29.58 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  27.16 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  44.26 
 
 
388 aa  53.9  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  25.18 
 
 
350 aa  52.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 
588 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  40.58 
 
 
578 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  23.05 
 
 
369 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
227 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  27.16 
 
 
325 aa  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  25.21 
 
 
388 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  23.53 
 
 
364 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  25.45 
 
 
367 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  25.41 
 
 
388 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 
188 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  24.83 
 
 
365 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
207 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  22.88 
 
 
378 aa  47.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  26.34 
 
 
362 aa  46.2  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3945  regulatory protein, LuxR  44.83 
 
 
191 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  24.83 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  23.91 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 
347 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 
568 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  24.81 
 
 
368 aa  43.1  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
377 aa  42.7  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>