105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2418 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  46.2 
 
 		 187 aa  124  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 191 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  37.97 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 369 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  32.46 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  34.02 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 416 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  35.47 
 
 		 380 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 405 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  47.5 
 
 		 385 aa  65.1  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 381 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 394 aa  62  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 398 aa  62  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 394 aa  61.6  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  36.27 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  31.41 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  38.18 
 
 		 568 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 370 aa  58.9  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 367 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 402 aa  57.8  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  40.51 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  34.94 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  42.03 
 
 		 588 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 586 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  31.32 
 
 		 395 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  32.03 
 
 		 380 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  48.39 
 
 		 275 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  45.59 
 
 		 387 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 391 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 381 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  27.14 
 
 		 367 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 377 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  33.11 
 
 		 417 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  33.11 
 
 		 417 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  29.35 
 
 		 373 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 411 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  41.79 
 
 		 374 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  37.35 
 
 		 369 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 229 aa  51.6  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 381 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  45.68 
 
 		 388 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  45.68 
 
 		 388 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 339 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 313 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 395 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  45.9 
 
 		 377 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  45.16 
 
 		 578 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  50 
 
 		 378 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 397 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  32 
 
 		 365 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 368 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 385 aa  48.5  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 377 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 383 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  47.06 
 
 		 392 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2015  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 130 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.842391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 367 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  33.72 
 
 		 393 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3945  regulatory protein, LuxR  46.55 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  33.72 
 
 		 392 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 362 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 363 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 380 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 379 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 360 aa  45.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  46.55 
 
 		 370 aa  45.1  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 		 350 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 381 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3235  hypothetical protein  42.37 
 
 		 275 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 329 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 375 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  34.57 
 
 		 385 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 372 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  37.04 
 
 		 356 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 374 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2543  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0159  LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 381 aa  42  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655678 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 545 aa  42  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3801  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 		 180 aa  42  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.05501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  28 
 
 		 215 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 376 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 363 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 363 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 363 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  29.01 
 
 		 378 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0081  regulatory protein, LuxR  40.32 
 
 		 589 aa  41.6  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318865  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>