48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2543 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2543  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 201 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2373  regulatory protein, LuxR  64.04 
 
 		 202 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 367 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 545 aa  49.7  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 363 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 363 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 363 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  26.49 
 
 		 374 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 279 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 363 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  40.35 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 402 aa  45.1  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.29 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2959  LuxR response regulator receiver  47.17 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45539  diatom response regulator 1  31.17 
 
 		 319 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3373  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3468  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0530935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4735  two component LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2015  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 130 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.842391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1903  transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000231921 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  40.74 
 
 		 380 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0894  putative outer membrane component of efflux system  26.47 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00401485  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 275 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  26.9 
 
 		 378 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0533  two component LuxR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.405575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  42.11 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 893 aa  42.4  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 198 aa  42  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 320 aa  42  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 294 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 294 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 270 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  32 
 
 		 237 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 187 aa  42  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23080  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.67 
 
 		 545 aa  42  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.865531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 378 aa  41.6  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 301 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06519  hypothetical protein  41.51 
 
 		 273 aa  41.6  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3299  LysR-family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 227 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3366  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 227 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.857101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.64 
 
 		 1019 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 277 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>