73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6030 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  99.72 
 
 		 363 aa  732    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 363 aa  733    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  85.67 
 
 		 363 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 363 aa  733    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 381 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  23.24 
 
 		 395 aa  89.4  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 372 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  24.66 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  21.05 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  26.74 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  26.58 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  22.68 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  27.09 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  26.6 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  27.15 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  26.74 
 
 		 377 aa  67  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  23.16 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  21.35 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  25.52 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  23.1 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  25.13 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  28.73 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  21.8 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  25.36 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  20.55 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  19.95 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  20.56 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 369 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  25.09 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 545 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 397 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 416 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  24.64 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 191 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1034  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 180 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.442901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  24.87 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  25.28 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  34.95 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  38.81 
 
 		 275 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  24.32 
 
 		 392 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2543  transcriptional regulator, LuxR family  57.45 
 
 		 201 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 381 aa  46.2  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 188 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  22.83 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 207 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0653  LuxR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 206 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.203226 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  45.61 
 
 		 588 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  27.64 
 
 		 364 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 		 568 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  26.5 
 
 		 411 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2373  regulatory protein, LuxR  53.19 
 
 		 202 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 381 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>