38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5477 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 378 aa  769    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  34.19 
 
 		 362 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  31.83 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3945  regulatory protein, LuxR  43.09 
 
 		 191 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  23.84 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  25.92 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 367 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  24.86 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  22.37 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  22.69 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 416 aa  54.3  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 191 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 588 aa  49.7  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  22.35 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  28.57 
 
 		 275 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  38.55 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 405 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 215 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  25 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  23.8 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2543  transcriptional regulator, LuxR family  26.9 
 
 		 201 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>