37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6253 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 362 aa  731    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  39.61 
 
 		 360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  34.19 
 
 		 378 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3945  regulatory protein, LuxR  37.31 
 
 		 191 aa  99.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  27.2 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  52.31 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3373  putative transcription regulator protein  23.08 
 
 		 336 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 416 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  24.64 
 
 		 373 aa  49.7  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  44.83 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  25.24 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2015  response regulator receiver protein  32.65 
 
 		 130 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.842391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 215 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 367 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  28.16 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 381 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 191 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0081  regulatory protein, LuxR  37.66 
 
 		 589 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 191 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 		 586 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  34.43 
 
 		 568 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2939  regulatory protein LuxR  34.02 
 
 		 128 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 588 aa  43.1  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 405 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>