70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2058 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 370 aa  740    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  34.64 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  31.64 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  22.84 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  20.52 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  21.22 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  29.86 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  50.75 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  27.44 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  28.02 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  27.19 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  22.55 
 
 		 370 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  29 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 402 aa  53.9  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 395 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 383 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  27.83 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3945  regulatory protein, LuxR  49.23 
 
 		 191 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 363 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 372 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 367 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  23.11 
 
 		 380 aa  49.7  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  22.65 
 
 		 385 aa  49.7  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  24.24 
 
 		 392 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  26.01 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  24 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 191 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  24 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  24.17 
 
 		 395 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  31.28 
 
 		 364 aa  48.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  38.55 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  52.54 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 213 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 213 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  21.46 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  24.74 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 207 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 191 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  26.54 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  36.36 
 
 		 275 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  32.03 
 
 		 187 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  27.52 
 
 		 295 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 588 aa  43.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 378 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 365 aa  42.7  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>