51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3602 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  746    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  28.41 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  28.41 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  30.04 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  29.13 
 
 		 393 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  25.81 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  28.17 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  27.38 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  37.21 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 191 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 362 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  43.68 
 
 		 187 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 377 aa  53.5  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 368 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 		 370 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  29 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 191 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  22.27 
 
 		 374 aa  49.7  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  24.91 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  26.52 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 188 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  26.32 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  40.91 
 
 		 568 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 207 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 227 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  30.77 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 215 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  39.34 
 
 		 275 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  25.22 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 586 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 365 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 416 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 367 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 		 588 aa  43.1  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 381 aa  42.7  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>