111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5497 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 395 aa  795    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  64.59 
 
 		 383 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 394 aa  360  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  44.92 
 
 		 395 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 391 aa  349  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 397 aa  189  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 379 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  31.37 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  31.23 
 
 		 381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  26.34 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  29.32 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  26.37 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 380 aa  94.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  27.06 
 
 		 385 aa  89.7  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  26.04 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  30.61 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  24.01 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 385 aa  87  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  29.46 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  22.51 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  27.4 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  23.4 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  27.74 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  29.03 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  28.88 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 363 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 363 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  28.16 
 
 		 367 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  24.72 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  24.74 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  30.08 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  30.08 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  20.54 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  30.4 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  29.13 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  32.08 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  28.23 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  27.27 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  27.89 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 		 588 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  27.78 
 
 		 275 aa  57  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 378 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  27.94 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  38.38 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  29.79 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 586 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 207 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 229 aa  53.9  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6272  transcriptional regulator, LuxR family  25.84 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3770  regulatory protein, LuxR  25.67 
 
 		 369 aa  53.1  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00240032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4901  transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 161 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 191 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  26.86 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  27.49 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  26.86 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  27.53 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 368 aa  47  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 363 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 222 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02316  transcription regulator protein  41.07 
 
 		 227 aa  46.2  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.499262 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0696  regulatory protein, LuxR  31.41 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1027  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>