80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1423 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  440  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  32.45 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  31.38 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  31.38 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  31.22 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  30.81 
 
 		 393 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 405 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  35.96 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 397 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  32.61 
 
 		 380 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 383 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  30.81 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  33.99 
 
 		 395 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  43.37 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  44.87 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  31.87 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  35.62 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  39.53 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 394 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  40 
 
 		 387 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 339 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 329 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 191 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  37.36 
 
 		 369 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 369 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 377 aa  52.4  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 378 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 416 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 372 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 379 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  44.3 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  52.24 
 
 		 388 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  52.24 
 
 		 388 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  43.55 
 
 		 588 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  45.61 
 
 		 388 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 368 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  45.57 
 
 		 381 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  35.71 
 
 		 578 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 402 aa  48.5  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 405 aa  48.5  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  32.6 
 
 		 378 aa  48.5  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 		 586 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 377 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 379 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  29.19 
 
 		 411 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  42.62 
 
 		 377 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 381 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  34.25 
 
 		 374 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 187 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 378 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 378 aa  45.4  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  31.45 
 
 		 568 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  32.24 
 
 		 392 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  38.1 
 
 		 364 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  28.72 
 
 		 370 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  32.53 
 
 		 350 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 385 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4220  LuxR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0992  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 493 aa  42.4  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 398 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2015  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 130 aa  42  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.842391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2786  transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 511 aa  42  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0490323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  46.55 
 
 		 378 aa  42  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>