55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0768 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  98.4 
 
 		 578 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  72.95 
 
 		 568 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 545 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 588 aa  52.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  41.77 
 
 		 187 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 411 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 191 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 191 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 213 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 		 586 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 405 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 369 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0081  regulatory protein, LuxR  27.01 
 
 		 589 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 381 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  44.83 
 
 		 380 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  38.82 
 
 		 380 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  43.94 
 
 		 387 aa  46.6  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  39.51 
 
 		 417 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  42.62 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  40.58 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  35.05 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  39.51 
 
 		 417 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  42.11 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 214 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  42.59 
 
 		 369 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 188 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  30.39 
 
 		 376 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  38.33 
 
 		 275 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  32.58 
 
 		 215 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  32.58 
 
 		 215 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  32.58 
 
 		 215 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  32.58 
 
 		 215 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  32.58 
 
 		 215 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  32.58 
 
 		 215 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  32.58 
 
 		 215 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 416 aa  42.7  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 378 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>