72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2426 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  69.78 
 
 
568 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  100 
 
 
578 aa  1104    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  98.4 
 
 
313 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6131  hypothetical protein  97.01 
 
 
234 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
545 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 
586 aa  75.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0081  regulatory protein, LuxR  24.07 
 
 
589 aa  70.5  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318865  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 
588 aa  69.3  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0293  alpha/beta hydrolase fold protein  41.94 
 
 
267 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0813  alpha/beta hydrolase fold  47.37 
 
 
309 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0816  alpha/beta hydrolase fold  47.37 
 
 
309 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0721579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0801  alpha/beta hydrolase fold  47.37 
 
 
309 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
310 aa  58.9  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13341  hypothetical protein  39.36 
 
 
308 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.650315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  45.16 
 
 
370 aa  54.7  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2299  alpha/beta hydrolase fold protein  43.3 
 
 
296 aa  53.5  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 
187 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
381 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 
272 aa  52.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
394 aa  52  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 
411 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
362 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
362 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
362 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3162  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
294 aa  50.4  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.571946 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 
213 aa  50.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 
213 aa  50.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
191 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
191 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
368 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0087  hypothetical protein  23.05 
 
 
291 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.451342  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
405 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 
370 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.44 
 
 
238 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
227 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
398 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  44.83 
 
 
380 aa  47.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
369 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
379 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  39.37 
 
 
272 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  35.48 
 
 
374 aa  47.4  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  39.29 
 
 
380 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  37.18 
 
 
271 aa  47  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
367 aa  47  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05308  conserved hypothetical protein  36.78 
 
 
137 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0111  alpha/beta hydrolase fold  47.54 
 
 
321 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0670852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0797  alpha/beta hydrolase fold  46.77 
 
 
316 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0173044  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  29.17 
 
 
328 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  43.48 
 
 
387 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3540  alpha/beta hydrolase  37.08 
 
 
295 aa  47  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291632  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
381 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  34.69 
 
 
385 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  40.58 
 
 
378 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.17 
 
 
372 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5766  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 
302 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  37.18 
 
 
273 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2625  alpha/beta hydrolase fold protein  38.3 
 
 
302 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000189214  hitchhiker  0.00302353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0189  alpha/beta family hydrolase  26.43 
 
 
314 aa  45.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  43.86 
 
 
377 aa  45.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
417 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  37.18 
 
 
273 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
417 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3278  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
305 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.654015  normal  0.634842 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  31.37 
 
 
376 aa  44.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1042  proline iminopeptidase  27.84 
 
 
316 aa  44.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.09 
 
 
2762 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
214 aa  44.3  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1153  Alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 
299 aa  43.9  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 
275 aa  43.9  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0743  alpha/beta hydrolase fold protein  31.31 
 
 
282 aa  43.9  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00683299  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  42.59 
 
 
369 aa  43.5  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 
370 aa  43.5  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>