81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7854 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  791    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  27.45 
 
 		 370 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  25.27 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  24.87 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 363 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  28.91 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  27.2 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  26.2 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  21.56 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  23.97 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  26.01 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  21.72 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  27.99 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  22.83 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  21.47 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  27.07 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  26.27 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  28 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  26.27 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  28 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  27.72 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  27.39 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  26.27 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  24.54 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  28.71 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  29.84 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  25.57 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  22.74 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 372 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  23.55 
 
 		 385 aa  54.3  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  24.66 
 
 		 375 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 362 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 378 aa  53.5  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  29.04 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  27.31 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  22.43 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  25.75 
 
 		 377 aa  50.4  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  25.19 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 227 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3373  putative transcription regulator protein  22.89 
 
 		 336 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1538  LuxR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 191 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8187  HNH endonuclease  26.9 
 
 		 276 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  22.49 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 		 588 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 191 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  22.98 
 
 		 337 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 893 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2939  regulatory protein LuxR  36.99 
 
 		 128 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3770  regulatory protein, LuxR  41.18 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00240032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>