155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3415 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 394 aa  775    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  99.48 
 
 		 386 aa  753    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  84 
 
 		 375 aa  610  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  31.02 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  32.17 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 369 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 368 aa  94  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  26.54 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  27.87 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  27.25 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  26.56 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  25.9 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 191 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  21.14 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  20.21 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  24.87 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  26.34 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  29.27 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  29.33 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  29 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2021  hypothetical protein  39.24 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  24.73 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  23.8 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  24.93 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  20.68 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  21.16 
 
 		 367 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 365 aa  53.5  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  41.54 
 
 		 588 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 226 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  37.18 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  22.22 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  25.34 
 
 		 377 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  40.58 
 
 		 586 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  25.63 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 280 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 280 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3826  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 519 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 282 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  38.2 
 
 		 176 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3200  LuxR family transcriptional regulator  37 
 
 		 205 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  49.18 
 
 		 955 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.65 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 178 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 178 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 175 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  28.18 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.55 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  37.65 
 
 		 188 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  34.57 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  22.98 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 394 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  27.08 
 
 		 187 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.21 
 
 		 207 aa  47  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1389  transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 478 aa  47  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.544965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  35.29 
 
 		 916 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1339  transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 188 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 208 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 237 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1080  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  44.23 
 
 		 823 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 261 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  31.82 
 
 		 218 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  41.94 
 
 		 262 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.11 
 
 		 211 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 216 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.245465  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  30.7 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>