112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4474 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 398 aa  777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  75 
 
 		 411 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 385 aa  179  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  36.01 
 
 		 385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 378 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 405 aa  99.8  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  28.21 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 395 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  31.33 
 
 		 373 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 383 aa  90.5  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  23.8 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  23.95 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  25 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  21.99 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  21.52 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  26.43 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  23.72 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  26.95 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  23.54 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  24.44 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  28.5 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  28.24 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  32.88 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  25.91 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 191 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 369 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  33.48 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  28.7 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 191 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  26.5 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  26.81 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  26.81 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  26.18 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  29.83 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 374 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  30.81 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 586 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  27.01 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  28.63 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  26.2 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  33.56 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  31.31 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4220  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  43.18 
 
 		 568 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 187 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.67 
 
 		 505 aa  49.7  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  40.28 
 
 		 275 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 222 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 329 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 215 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  23.64 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0768  LuxR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2426  regulatory protein, LuxR  43.37 
 
 		 578 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0946556 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  38.81 
 
 		 222 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27360  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.05 
 
 		 517 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0445329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 175 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.06 
 
 		 215 aa  46.6  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  24.26 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  23.83 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  41.38 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  28.32 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  30.23 
 
 		 213 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  33.9 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  30.23 
 
 		 213 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 272 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1903  transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 196 aa  43.9  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000231921 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>