197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2412 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  757    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  27.54 
 
 		 411 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  20.21 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  22.56 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  24.34 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  26.2 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 367 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  25.71 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  23.54 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  29.09 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  23.08 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  30.45 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  30.45 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  19.26 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  25.27 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  24.07 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  30.9 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  30.6 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  24.42 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  25.89 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  28.63 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4220  LuxR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 222 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  31.72 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  43.84 
 
 		 321 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12700  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.14 
 
 		 488 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 		 586 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  35.64 
 
 		 369 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  26.82 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  25.29 
 
 		 373 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23080  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.21 
 
 		 545 aa  53.5  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.865531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.62 
 
 		 512 aa  53.1  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  25.57 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  43.86 
 
 		 588 aa  53.1  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 381 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0440  transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 526 aa  52.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 229 aa  52.8  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.1 
 
 		 515 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  27.44 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  25.46 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 380 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2816  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 471 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  hitchhiker  0.00338242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 191 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0184  transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 507 aa  50.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0406  transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 		 486 aa  50.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0269651 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01760  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.52 
 
 		 546 aa  50.1  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000265618 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17090  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.48 
 
 		 485 aa  49.7  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0518  transcriptional regulator, LuxR family  32.77 
 
 		 488 aa  49.7  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.982453  normal  0.339001 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  26.46 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0617  transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 505 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0935525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3038  transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 569 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 368 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0520  transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 520 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.1412 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3022  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.77 
 
 		 485 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.709367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  47.27 
 
 		 955 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0461  transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 		 542 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 213 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 213 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  21.51 
 
 		 337 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0496  transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 510 aa  47  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.484054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  19.02 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  25 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  25.76 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 522 aa  47  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>