More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6272 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6272  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 394 aa  799    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5553  transcriptional regulator, LuxR family  38.07 
 
 		 373 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  33.16 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1731  response regulator receiver protein  36.6 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3397  two component LuxR family transcriptional regulator  33 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3866  response regulator receiver  35.26 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.370865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.69 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  65.38 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1587  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.522901  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.88 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2002  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.34 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0591  two component LuxR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477799  hitchhiker  0.00469436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.54 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1761  two component LuxR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.54 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1445  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.446624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  62.75 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3574  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.34 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0249095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3692  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.26 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3383  response regulator receiver  59.26 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1665  two component LuxR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 307 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5514  two component LuxR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.211273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1713  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3730  two component LuxR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4638  two component LuxR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5666  two component LuxR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3147  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.42 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3838  transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  46.03 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2681  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3341  response regulator receiver protein  53.85 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0108642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0759  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 221 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1927  LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1291  transcriptional regulator, LuxR family  36.47 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.979242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1874  LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2984  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  48.15 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1991  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.95 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.141856  hitchhiker  0.00484475 
 
 
-
 
NC_003296  RS02135  putative transcription regulator protein  31.94 
 
 		 252 aa  57  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 201 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00878  two-component response regulator  46.3 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0238  LuxR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0296  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 198 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 224 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2997  LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 250 aa  54.7  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.665573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  45.16 
 
 		 521 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 220 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 209 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1895  putative transcription regulator protein  31.9 
 
 		 252 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.030885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1471  DNA-binding response regulator  34.52 
 
 		 363 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100474  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 230 aa  53.9  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0524  hypothetical protein  28.41 
 
 		 253 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 840 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 194 aa  53.5  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1795  DNA-binding response regulator  35.37 
 
 		 279 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0488628  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0531  transcriptional regulator, LuxR family  30.09 
 
 		 529 aa  53.5  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.614613  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 775 aa  53.1  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 814 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4417  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 232 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1165  DNA-binding response regulator  35.37 
 
 		 279 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000742681  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0704  DNA-binding response regulator  35.37 
 
 		 279 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000213253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1325  putative DNA-binding response regulator  35.37 
 
 		 279 aa  53.5  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0852238  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1334  putative DNA-binding response regulator  35.37 
 
 		 279 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0448  DNA-binding response regulator  35.37 
 
 		 279 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00573595  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.59 
 
 		 203 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 285 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 230 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1094  DNA-binding response regulator  34.12 
 
 		 279 aa  53.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000582737  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5656  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.7 
 
 		 222 aa  53.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 212 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 224 aa  52.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1690  two component LuxR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 215 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.61 
 
 		 913 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 226 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 258 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 225 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4288  metal dependent phosphohydrolase  42.62 
 
 		 519 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.472516  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 876 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.27 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  53.06 
 
 		 216 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2579  LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.286869  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.73 
 
 		 261 aa  52.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 221 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>