24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2021 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2021  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  23.96 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  22.42 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  25.42 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  40.79 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  40.79 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  20.96 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  24.5 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 381 aa  53.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 397 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 		 588 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 191 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  25.23 
 
 		 405 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  23.62 
 
 		 378 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  37.88 
 
 		 586 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 377 aa  48.9  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 416 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  32.43 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 370 aa  42.7  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  43.48 
 
 		 381 aa  42.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>