More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1533 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1533  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  270  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.717435  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  60.63 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2814  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 146 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2902  LuxR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2289  regulatory protein LuxR  34.27 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 223 aa  66.6  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.84 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2359  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.69 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0990205  decreased coverage  0.00133027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.44 
 
 		 223 aa  63.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.253855  normal  0.0592312 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 194 aa  63.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 222 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  52.46 
 
 		 1019 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  47.37 
 
 		 906 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01037  DNA-binding transcriptional activator in two-component regulatory system  40.7 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  48.39 
 
 		 917 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01044  hypothetical protein  40.7 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1253  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  40.7 
 
 		 216 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.705931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 905 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  46.05 
 
 		 905 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1238  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  40.7 
 
 		 216 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2048  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  40.7 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0804096  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1208  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  40.7 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316434  normal  0.419874 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2231  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  40.7 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  normal  0.99411 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2605  transcriptional regulator, LuxR family  40.7 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.196673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2093  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  40.7 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1159  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  40.7 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2559  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  40.7 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.980478  normal  0.382247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1158  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  40.7 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.354651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1419  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  40.7 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 254 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  54.9 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.18 
 
 		 913 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  50.98 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50.82 
 
 		 905 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 208 aa  60.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.32 
 
 		 922 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.33 
 
 		 213 aa  60.5  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  54.1 
 
 		 309 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 361 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.77 
 
 		 216 aa  60.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1556  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  40.7 
 
 		 216 aa  60.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417219  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.18 
 
 		 905 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 222 aa  60.5  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  34.17 
 
 		 223 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 906 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  43.37 
 
 		 920 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0169  transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.1 
 
 		 947 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4897  response regulator receiver  49.12 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275297  normal  0.216824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  44.29 
 
 		 900 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  49.18 
 
 		 914 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1600  LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240626  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0229  putative metal dependent phosphohydrolase  45.9 
 
 		 474 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  45.9 
 
 		 873 aa  57.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1794  transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 537 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000182459 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  36.21 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3149  response regulator receiver protein  52.73 
 
 		 325 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0415975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 236 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0907  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.18 
 
 		 850 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4706  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.31 
 
 		 911 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157543 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  35.63 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  39.58 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  44.87 
 
 		 910 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.82 
 
 		 217 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3710  LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 426 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 257 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 230 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  52.94 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  52.94 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  52.94 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  52.94 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  52.94 
 
 		 209 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 231 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3005  two component LuxR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 217 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00815247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 227 aa  57  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  43.28 
 
 		 899 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 213 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  50 
 
 		 207 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 223 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  43.42 
 
 		 904 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>