More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32990 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  100 
 
 		 217 aa  428  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  46.54 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.6 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.13 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.79 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.91 
 
 		 228 aa  177  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.82 
 
 		 227 aa  175  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  45.7 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.75 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  47.47 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.54 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.49 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  47.22 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.75 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  46.26 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  46.33 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 226 aa  167  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 229 aa  167  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.4 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  42.79 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.66 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.64 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.5 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.12 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.76 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.5 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.47 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.66 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.32 
 
 		 222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  44.24 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.12 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3287  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0842926  normal  0.330639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  43.05 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0232  response regulator receiver protein  43.81 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.57 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.91 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  44.86 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.73 
 
 		 225 aa  161  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.98 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  44.09 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.04 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.13 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.12 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.67 
 
 		 242 aa  159  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  43.93 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.95 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.52 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.44 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  40.53 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.26 
 
 		 241 aa  157  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 215 aa  157  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 250 aa  157  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  43.98 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.01 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.24 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.55 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  43.46 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.69 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.56 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  42.4 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  41.89 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.4 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2225  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.34 
 
 		 209 aa  155  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  44.95 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2352  two component LuxR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.73 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.59 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4946  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.01 
 
 		 224 aa  154  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 210 aa  154  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0199  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.53 
 
 		 232 aa  154  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.78 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1972  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 217 aa  153  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000794288  unclonable  0.0000000332591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.25 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.08 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1731  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.45 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>