More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2513 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2513  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 78 aa  158  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1009  LuxR family transcriptional regulator  72.41 
 
 		 74 aa  90.1  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000248163  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3176  two component LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0570221  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2046  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 219 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1379  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 292 aa  52  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0210202  hitchhiker  0.00446461 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1291  transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 300 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.979242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1531  LuxR family DNA-binding response regulator  46.55 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000956559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 209 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1738  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.949758 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 219 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0502  regulatory protein, LuxR  47.37 
 
 		 861 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0169233  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1094  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 279 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000582737  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 230 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 222 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1471  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 363 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100474  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1334  putative DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 279 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.07086  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  51.02 
 
 		 998 aa  50.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1795  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 279 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0488628  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5085  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 218 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1165  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 279 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000742681  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0704  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 279 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000213253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1325  putative DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 279 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0852238  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0448  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 279 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00573595  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0353  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  51.02 
 
 		 947 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3305  LuxR family DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 206 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1975  two component LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 293 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1501  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 228 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.138703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4386  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 209 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2280  two component LuxR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 214 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.457915 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  34.25 
 
 		 309 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 304 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0473  transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 488 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5117  two component LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 253 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.180541 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.1 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3199  response regulator receiver protein  37.97 
 
 		 212 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 919 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0169  transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 246 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.94 
 
 		 211 aa  48.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315732  normal  0.450672 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  40.98 
 
 		 919 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  40.98 
 
 		 919 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 918 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0948  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.77 
 
 		 214 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 209 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5778  cyclic nucleotide-binding protein  35 
 
 		 353 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.714206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3393  transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 201 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.269822  hitchhiker  0.000260191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4850  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.18 
 
 		 257 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.0399542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 526 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3909  two component LuxR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 211 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.755905  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 222 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2524  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 228 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0516799  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 		 526 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 		 526 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0582  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 204 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1236  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.23752  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 228 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3908  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 214 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3983  two component LuxR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 214 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.714996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 339 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.68 
 
 		 217 aa  47.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3924  two component LuxR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 214 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1858  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 222 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0266898  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1813  two component LuxR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 249 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 227 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0596  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  38.6 
 
 		 911 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 907 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  44.9 
 
 		 948 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2563  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 229 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6700  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 257 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4455  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 226 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3140  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.803361  normal  0.270175 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0465  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 239 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.31 
 
 		 215 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0157  transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 321 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.92 
 
 		 881 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2258  transcriptional regulator, LuxR family  46.94 
 
 		 476 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1617  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  43.14 
 
 		 921 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1746  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 222 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139209  normal  0.0305301 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0392  transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 529 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  37.04 
 
 		 977 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  37.74 
 
 		 230 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.66 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0555  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.25 
 
 		 227 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>