More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1009 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1009  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000248163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2513  LuxR family transcriptional regulator  72.41 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2046  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 219 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1738  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 219 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.949758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 209 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 222 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3811  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252848 
 
 
-
 
NC_002936  DET1531  LuxR family DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000956559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  42.31 
 
 		 911 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.71 
 
 		 921 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  39.66 
 
 		 215 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.71 
 
 		 921 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.71 
 
 		 921 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.02 
 
 		 932 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  45.28 
 
 		 215 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 227 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 227 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1992  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 218 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  45.28 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  45.28 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3909  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 211 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.755905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  45.28 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4147  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 218 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3983  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 214 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.714996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3924  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 214 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4386  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 209 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 223 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  36.73 
 
 		 275 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.32 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0315732  normal  0.450672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 356 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3221  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 261 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0169  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 246 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 304 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 994 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 226 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0908  LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 526 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0423  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 213 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.450903  hitchhiker  0.0058743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0925  metal dependent phosphohydrolase  44.64 
 
 		 526 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0502  regulatory protein, LuxR  43.14 
 
 		 861 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0169233  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0915  metal dependent phosphohydrolase  44.64 
 
 		 526 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.691229  decreased coverage  0.00674138 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  39.29 
 
 		 207 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0555  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 227 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 213 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1291  transcriptional regulator, LuxR family  34.55 
 
 		 300 aa  45.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.979242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.637953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1858  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00870294  decreased coverage  0.00000000166193 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 309 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 207 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2606  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00642184  hitchhiker  0.00275886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2247  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.998494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0652  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 305 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 232 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2493  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1250  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 309 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3762  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 221 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.355338  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 951 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0582  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.09 
 
 		 204 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0353  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 213 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5085  LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 230 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 223 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  39.66 
 
 		 203 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2648  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 220 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 207 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  43.4 
 
 		 215 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  43.4 
 
 		 215 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  43.4 
 
 		 215 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  43.4 
 
 		 215 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  43.4 
 
 		 215 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 218 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2814  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 214 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 349 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 544 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0618082  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1663  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0154836  unclonable  0.0000152825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1819  putative transcriptional regulator  35.82 
 
 		 243 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145412  normal  0.357363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1284  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.9 
 
 		 209 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.346883 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 544 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.83 
 
 		 308 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 207 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  41.07 
 
 		 207 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1653  response regulator receiver protein  34.92 
 
 		 220 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  39.62 
 
 		 222 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.62 
 
 		 221 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1932  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 236 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 215 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 353 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 230 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  41.07 
 
 		 215 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1399  transcriptional regulator NarL  35.59 
 
 		 219 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  41.07 
 
 		 215 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  41.07 
 
 		 215 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  41.07 
 
 		 215 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  41.07 
 
 		 215 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>