More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02940 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02940  putative LuxR-family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3768  LuxR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 231 aa  90.5  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1314  transcriptional regulator, LuxR family  32.28 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0302  LuxR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3200  LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2348  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3945  LuxR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00801334  normal  0.811932 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3096  regulatory protein, LuxR  31.39 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.735562  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0720  LuxR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0333677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3414  LuxR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.295313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.58 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3137  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0863  transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.07 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0205  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0596  two component LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.08 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3500  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0864  LuxR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0149  DNA-binding response regulator  29.93 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.88 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.12 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1222  two component LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0855  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.89 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.082304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  29.2 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2235  regulatory protein, LuxR  36.94 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0795  regulatory protein LuxR  35.14 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000492678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 224 aa  62  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.76 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3302  LuxR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 221 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1152  two component LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0840  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0408  two component LuxR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0960  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0875  LuxR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.66 
 
 		 258 aa  62  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85724  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  25.71 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173401  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.66 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0331  LuxR family DNA-binding response regulator  25.71 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2455  response regulator VSRC transcription regulator protein  44.62 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1617  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2334  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.477601  normal  0.267999 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.00104431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2723  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.8 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.03 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.61 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0341  two component LuxR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1151  two component LuxR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.08 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04500  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.65 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3409  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.33 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306896  hitchhiker  0.000114505 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0894  putative outer membrane component of efflux system  30.33 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00401485  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1981  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.607794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.65 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0166  transcriptional regulator, LuxR family protein  28.46 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00243136  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  33.33 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3452  putative PAS/PAC sensor protein  52.46 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413638  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0164  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.98 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0441129 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4133  two component LuxR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2880  two component LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2948  response regulator receiver protein  29.79 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  33.6 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3887  LuxR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000207134 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.27 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2367  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.08 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1686  two component LuxR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173725  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2417  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.08 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  31.03 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1874  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.08 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.75 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>