198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1892 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1892  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  544  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3221  transcriptional regulator, LuxR family  63.1 
 
 		 261 aa  348  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1260  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1723  LuxR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620494 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0757  LuxR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2364  transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461872  normal  0.284664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1964  transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  28.71 
 
 		 496 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  24.42 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0160  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 947 aa  49.3  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3592  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 293 aa  48.9  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0118916  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 227 aa  48.9  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2962  response regulator receiver  40 
 
 		 206 aa  48.9  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.117851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  40.35 
 
 		 873 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63520  putative transcriptional regulator  24.22 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 981 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 943 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0261  two component LuxR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.574059  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  27.41 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4133  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  26.09 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1751  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 376 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0602  transcriptional regulator, LuxR family protein  38.98 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126322  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 496 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  35.71 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  41.38 
 
 		 964 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4179  hypothetical protein  48 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 496 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 894 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1182  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 216 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192356 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1161  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.675286  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1399  transcriptional regulator NarL  38.46 
 
 		 219 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0079  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 319 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1000  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 319 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0913  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1539  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 319 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2443  LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 497 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0671  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 333 aa  45.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3760  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358522  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 230 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 299 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0290  response regulator receiver protein  32.99 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2240  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 236 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  44.9 
 
 		 933 aa  45.4  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4126  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 202 aa  45.4  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.23 
 
 		 981 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 881 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0522  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0596  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 491 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  46.43 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 881 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3869  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 301 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 876 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4184  hypothetical protein  44.23 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.400045  normal  0.380291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  42.86 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  46.94 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.98 
 
 		 880 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0869  response regulator  43.14 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  43.55 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 308 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 514 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 514 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  46.43 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  46.43 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 514 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5154  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 510 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17670  LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  46.43 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 510 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 335 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2218  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  22.78 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  46.43 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  46.43 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  46.43 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1537  putative two-component response regulator  43.55 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  27.39 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  46.43 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1134  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6529  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.94 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  0.114568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.33 
 
 		 1021 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 510 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  46.43 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>