More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3592 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3592  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 293 aa  600  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0118916  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4824  hypothetical protein  40.4 
 
 		 205 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4828  hypothetical protein  37.69 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.758784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2071  hypothetical protein  31.86 
 
 		 208 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3888  hypothetical protein  28.79 
 
 		 212 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5525  hypothetical protein  31.49 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.155419  normal  0.748971 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1080  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 1128 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 1359 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0842  hypothetical protein  30.39 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 626 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  27.03 
 
 		 494 aa  89.7  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 960 aa  89.4  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3188  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 810 aa  87  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2076  hypothetical protein  29.51 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000127154  hitchhiker  0.000119468 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 614 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0930  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.95 
 
 		 736 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.165473  normal  0.215499 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  26.78 
 
 		 676 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 973 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 		 614 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  58.06 
 
 		 758 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3257  GGDEF domain-containing protein  27.78 
 
 		 531 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  24.73 
 
 		 1248 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  24.04 
 
 		 1019 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2675  Tetratricopeptide TPR_4  54.55 
 
 		 870 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00129539  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  57.14 
 
 		 955 aa  62.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  51.67 
 
 		 951 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 		 952 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5016  hypothetical protein  32.35 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.705359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 882 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  44.26 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  46.77 
 
 		 887 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50.91 
 
 		 981 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_002950  PG1237  LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06810  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.85 
 
 		 520 aa  59.3  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 963 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  45.35 
 
 		 1085 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 768 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2525  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3305  LuxR family DNA-binding response regulator  30.67 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2431  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  41.94 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0974  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  0.426964 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0072  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 477 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.323936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 943 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 905 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2725  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 222 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 234 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  42.03 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  42.86 
 
 		 776 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  42.67 
 
 		 940 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19740  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.07 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 929 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.67 
 
 		 923 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4864  DNA binding domain-containing protein  33.03 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.68065  normal  0.158916 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 913 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  35.94 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.08 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2735  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 87 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.382705  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  44.59 
 
 		 932 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  42.37 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  43.48 
 
 		 921 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  35.94 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 938 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  35.92 
 
 		 947 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 974 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 225 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1153  LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 960 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 946 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 876 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  42.67 
 
 		 904 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  47.17 
 
 		 900 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 225 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 223 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 881 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 496 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 881 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 895 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  37.88 
 
 		 202 aa  53.1  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2284  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 		 323 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0993778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 894 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 496 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 224 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>