94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5547 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 276 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  23.81 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  28.19 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  21.6 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5172  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0774  regulatory protein, LuxR  25.2 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  28.03 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  29.5 
 
 		 250 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 204 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3525  response regulator receiver protein  24.54 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243537  normal  0.113939 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1180  LuxR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  25.29 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  23.4 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2929  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 462 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  30.46 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  23.51 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  23.44 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 259 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 301 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3754  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00290124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2723  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 509 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  30.95 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  27.83 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.31 
 
 		 536 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00480  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.9 
 
 		 606 aa  44.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00118843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1356  regulatory protein, LuxR  34.67 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2049  response regulator receiver protein  22.14 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2601  regulatory protein, LuxR  28.26 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.119177 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3237  response regulator  40 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0757  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  40.74 
 
 		 188 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3630  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00295856  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3452  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 227 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  hitchhiker  0.00000787423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  31.91 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 272 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03970  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  29.36 
 
 		 195 aa  42.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000171758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 370 aa  42.7  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  25.56 
 
 		 247 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0320  response regulator receiver protein  21.85 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319961 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 586 aa  42.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13550  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.8 
 
 		 506 aa  42.4  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0514  transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 493 aa  42.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.559597 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2693  transcriptional regulator, LuxR family  35.09 
 
 		 80 aa  42  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>