100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5386 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5386  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 272 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.953712  normal  0.0884729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1220  LuxR family transcriptional regulator  92.96 
 
 		 272 aa  520  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4190  LuxR family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 272 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4124  LuxR family transcriptional regulator  61.71 
 
 		 269 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000894771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0876  LuxR family transcriptional regulator  61.34 
 
 		 269 aa  325  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2728  LuxR family transcriptional regulator  55.6 
 
 		 272 aa  292  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108423  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0888  LuxR family transcriptional regulator  63.24 
 
 		 204 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4782  transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3411  LuxR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0444105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10980  hypothetical protein  29.36 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2821  LuxR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.842744  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6270  LuxR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4862  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0800  LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6308  transcriptional regulator, LuxR family  29.93 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220056  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1019  LuxR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0774  regulatory protein, LuxR  30.43 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6064  LuxR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2166  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7684  LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.986809  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2575  regulatory protein, LuxR  26.69 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.940771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3718  response regulator receiver protein  24.6 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3201  LuxR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2590  LuxR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.572263  normal  0.168073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2587  LuxR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0358062  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3251  LuxR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2781  LuxR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  23.31 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3129  LuxR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 303 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4239  regulatory protein, LuxR  25.91 
 
 		 312 aa  48.9  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 262 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0618  LuxR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3531  LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272328  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 261 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  41.07 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 268 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5001  transcriptional regulator, LuxR family  22.82 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6468  LuxR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3735  LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 213 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5198  LuxR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6179  transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1172  LuxR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.244501 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1446  response regulator receiver protein  24.55 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  40.74 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3790  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2828  transcriptional regulator SyrR  39.68 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00104787  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6466  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2086  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.92 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3394  LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4122  LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161266 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  40.74 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4773  LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5547  putative LuxR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3042  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3769  regulatory protein, LuxR  41.51 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.997171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2786  LuxR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3423  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 202 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 215 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4745  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 209 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2114  LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 435 aa  42.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2216  LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2765  LuxR family transcriptional regulator  38 
 
 		 77 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45250  putative transcriptional regulator  35.09 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3335  LuxR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 277 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1260  LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 255 aa  42.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  35.09 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  38.33 
 
 		 188 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4854  response regulator receiver protein  22.13 
 
 		 262 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>