More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0272 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0272  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264008  normal  0.348846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3417  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.45 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.901274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3071  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 232 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  36.49 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  36.05 
 
 		 265 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2153  two component LuxR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.848776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2835  two component LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6653  two component LuxR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879715  hitchhiker  0.00000102566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  34.76 
 
 		 220 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3986  two component LuxR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.039666 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  30.43 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  31.25 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  27.88 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2713  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 216 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  28.29 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  27.6 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  27.6 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  27.88 
 
 		 216 aa  99.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  27.8 
 
 		 216 aa  99  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3619  LuxR response regulator receiver  34.38 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  32.69 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17330  Two-component response regulator, LuxR family  32.38 
 
 		 211 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  33.01 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  27.8 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.98 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.8 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  27.8 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  27.8 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  27.8 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  31.94 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  27.8 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  27.8 
 
 		 217 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  27.8 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  27.8 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  27.8 
 
 		 217 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  27.8 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  27.8 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  27.8 
 
 		 217 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5409  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.05 
 
 		 223 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  27.8 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  27.8 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  32.68 
 
 		 214 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 215 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0319702  normal  0.0827208 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  33.82 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0849  two component LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.64 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4702  two component LuxR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121015 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  32.04 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.7 
 
 		 216 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173401  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  29.27 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  29.27 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  29.27 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  34.1 
 
 		 215 aa  92.8  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4070  two component LuxR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  29.27 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1545  two component LuxR family transcriptional regulator  31 
 
 		 219 aa  92.8  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  29.27 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  29.27 
 
 		 214 aa  92.4  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0630  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.14 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.210211 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  29.27 
 
 		 214 aa  92.4  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  29.27 
 
 		 226 aa  92  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 215 aa  91.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4235  two component LuxR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 215 aa  91.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  29.06 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0347  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.62 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.69 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>