More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4225 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  53.21 
 
 		 220 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  52.75 
 
 		 220 aa  235  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  52.29 
 
 		 220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  51.38 
 
 		 220 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  51.38 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  46.76 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  46.76 
 
 		 230 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  50.46 
 
 		 214 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  45.95 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  46.4 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.42 
 
 		 229 aa  201  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 229 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1021  putative response regulator  50 
 
 		 214 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4965  two component LuxR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 214 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1693  LuxR response regulator receiver  43.38 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6665  two component LuxR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0397086  normal  0.0268041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3357  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3078  response regulator transcription regulator protein  42.01 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0498276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  42.45 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3543  two component LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4824  two component LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5459  two component LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953036  normal  0.183697 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  42.51 
 
 		 216 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  42.03 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  43.48 
 
 		 216 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4728  two component LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825096  normal  0.434564 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  43.48 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  43.48 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  43.48 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  43.48 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  43.48 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  43.48 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  41.4 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  43.48 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  43.48 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  43.48 
 
 		 216 aa  158  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  41.55 
 
 		 216 aa  158  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  42.03 
 
 		 217 aa  158  9e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  42.03 
 
 		 217 aa  158  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  42.03 
 
 		 217 aa  158  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  43.48 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  43.48 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  40.38 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4205  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0355  two component LuxR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0880  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0630  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.210211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3273  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.04 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3388  two-component response regulator transcription regulator protein  42.06 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0201761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4070  two component LuxR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3779  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  39.91 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  37.09 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 		 210 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3986  two component LuxR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.039666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4069  two component LuxR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0473  DNA-binding response regulator  39.44 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0879  DNA-binding response regulator  39.44 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1640  capsular synthesis regulator component B  39.44 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1403  DNA-binding response regulator  39.44 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.846273  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.68 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1797  DNA-binding response regulator  39.44 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1618  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0685  capsular synthesis regulator component B  39.44 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394747  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.57 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6659  two component LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000389797  hitchhiker  0.000384101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  38.14 
 
 		 213 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000032992  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3667  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  141  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0631  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.151672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0735  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.98 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  34.91 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.2 
 
 		 212 aa  135  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3939  two component transcriptional regulator  38.07 
 
 		 300 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0356  two component LuxR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  35.58 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4702  two component LuxR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121015 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3619  LuxR response regulator receiver  36.87 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4699  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372391  hitchhiker  0.00465492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.78 
 
 		 221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 219 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141427  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0629  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0030  two component LuxR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4641  two component LuxR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.169112  normal  0.068024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0283  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 		 208 aa  122  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393471  normal  0.0532877 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4692  two component LuxR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00363591  hitchhiker  0.0000170982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0354  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>