More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2835 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2835  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803464  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3071  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.74 
 
 		 232 aa  222  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3417  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.74 
 
 		 232 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.901274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6653  two component LuxR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879715  hitchhiker  0.00000102566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2153  two component LuxR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.848776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  40.81 
 
 		 265 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  40.54 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.02 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0319702  normal  0.0827208 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  33.18 
 
 		 212 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4965  two component LuxR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3619  LuxR response regulator receiver  32.86 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0272  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.27 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264008  normal  0.348846 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  33.33 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3986  two component LuxR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.039666 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  33.64 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  33.64 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  33.64 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  33.64 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  33.64 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  33.64 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  33.64 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  33.64 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  33.64 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  33.64 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  33.64 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  33.64 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3667  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  31.98 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  31.78 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  31.63 
 
 		 216 aa  99  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  29.2 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  32.09 
 
 		 216 aa  99  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  33.18 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 218 aa  98.6  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  31.63 
 
 		 216 aa  98.2  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4692  two component LuxR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00363591  hitchhiker  0.0000170982 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  29.91 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  29.91 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  29.6 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  31.92 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  30.04 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  31.16 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  32.56 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  29.15 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3939  two component transcriptional regulator  30.73 
 
 		 300 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  32.56 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  32.56 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  33.49 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 219 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0735  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 235 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1693  LuxR response regulator receiver  32.88 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1034  DNA-binding response regulator  34.11 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.315998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2225  DNA-binding response regulator  34.11 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4702  two component LuxR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121015 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.44 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  29.77 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2078  LuxR family DNA-binding response regulator  34.11 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.71 
 
 		 211 aa  93.6  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2022  DNA-binding response regulator  34.11 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  30.97 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.11 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 232 aa  91.7  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1621  capsular synthesis response regulator transcription regulator protein  31.53 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  32.09 
 
 		 213 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4641  two component LuxR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.169112  normal  0.068024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.48 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0030  two component LuxR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3273  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 215 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4121  DNA-binding transcriptional activator UhpA  35.07 
 
 		 196 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03553  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system wtih UhpB  34.6 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0034  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.6 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4250  DNA-binding transcriptional activator UhpA  34.6 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3882  DNA-binding transcriptional activator UhpA  34.6 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03495  hypothetical protein  34.6 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0030  DNA-binding transcriptional activator UhpA  34.6 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4178  DNA-binding transcriptional activator UhpA  34.6 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5099  DNA-binding transcriptional activator UhpA  34.6 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0828785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>