More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2366 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  100 
 
 		 228 aa  434  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  100 
 
 		 228 aa  434  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 216 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  100 
 
 		 216 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  100 
 
 		 216 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  100 
 
 		 216 aa  433  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  100 
 
 		 216 aa  433  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  99.07 
 
 		 216 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  99.07 
 
 		 216 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  99.07 
 
 		 216 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  99.07 
 
 		 216 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  99.07 
 
 		 216 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  98.15 
 
 		 216 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  93.98 
 
 		 216 aa  410  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  92.13 
 
 		 216 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  92.13 
 
 		 218 aa  401  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  91.2 
 
 		 217 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  91.2 
 
 		 217 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  95.19 
 
 		 216 aa  397  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  91.2 
 
 		 217 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  94.71 
 
 		 216 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000032992  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  40.57 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 241 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 235 aa  158  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  39.44 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  40.58 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0735  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.35 
 
 		 208 aa  151  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  36.76 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  41.35 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  41.35 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  38.05 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  40.3 
 
 		 212 aa  148  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  40.65 
 
 		 220 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  35.61 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  35.61 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 223 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3939  two component transcriptional regulator  37.74 
 
 		 300 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.3 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1618  DNA-binding response regulator  37.13 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1640  capsular synthesis regulator component B  37.13 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0685  capsular synthesis regulator component B  37.13 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394747  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0879  DNA-binding response regulator  37.13 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1797  DNA-binding response regulator  37.13 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0473  DNA-binding response regulator  37.13 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1403  DNA-binding response regulator  37.13 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.846273  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3619  LuxR response regulator receiver  38.92 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 217 aa  138  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  35.61 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59770  putative two component response regulator  38.71 
 
 		 231 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114482  hitchhiker  1.6476100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 224 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3018  LuxR family DNA-binding response regulator  38.71 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4965  two component LuxR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6665  two component LuxR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0397086  normal  0.0268041 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  36.14 
 
 		 210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3357  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 215 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  35.61 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3273  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.96 
 
 		 215 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.89 
 
 		 222 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1021  putative response regulator  37.56 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4235  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4702  two component LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121015 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3078  response regulator transcription regulator protein  34.65 
 
 		 222 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0498276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0354  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0629  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452847  normal  0.285643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1693  LuxR response regulator receiver  34.74 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3388  two-component response regulator transcription regulator protein  32.39 
 
 		 215 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0201761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0283  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.73 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393471  normal  0.0532877 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4641  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 213 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.169112  normal  0.068024 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0630  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.210211 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1034  DNA-binding response regulator  32.21 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.315998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2225  DNA-binding response regulator  32.21 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2078  LuxR family DNA-binding response regulator  32.21 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2022  DNA-binding response regulator  32.21 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0631  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.151672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4069  two component LuxR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4071  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0356  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3986  two component LuxR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.039666 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2153  two component LuxR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.848776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4692  two component LuxR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00363591  hitchhiker  0.0000170982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0355  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  30.54 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4070  two component LuxR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5459  two component LuxR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953036  normal  0.183697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>