More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4636 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4636  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 320 aa  635    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4901  transcriptional regulator, LuxR family  36.45 
 
 		 161 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.18 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5878  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.14 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.464013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.93 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.01 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0199  response regulator receiver protein  52.31 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.72 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0759  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.36 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1817  LuxR response regulator receiver  47.5 
 
 		 236 aa  57  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  35.94 
 
 		 1085 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  58.18 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.45 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 901 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  50 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3944  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 204 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  50.88 
 
 		 228 aa  55.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  57.14 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.55 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 882 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 1137 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 929 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  42.5 
 
 		 894 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1981  two component LuxR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.607794  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 226 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2024  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 220 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 228 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  45 
 
 		 206 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 963 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0261  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.574059  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 242 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 209 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  56 
 
 		 217 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 230 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 		 234 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.16 
 
 		 225 aa  52.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 224 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 215 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 242 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 236 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 219 aa  52.8  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 886 aa  52.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 226 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.6 
 
 		 225 aa  52.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  40.96 
 
 		 953 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 856 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  56 
 
 		 223 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 217 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.39 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0211  two component LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 227 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.196171  normal  0.645513 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  35.05 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  43.55 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  47.69 
 
 		 776 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0857  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00237341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4219  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  hitchhiker  0.000784643 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0290  response regulator receiver protein  41.43 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0902  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 208 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19740  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.61 
 
 		 216 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2846  two component LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  52.73 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 208 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  51.79 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3028  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.45 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  decreased coverage  0.0000266978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0691  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 227 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17000  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 233 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.33 
 
 		 236 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  42.47 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 213 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  38.36 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  38.36 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5428  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 201 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  38.36 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  38.36 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 224 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 224 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3502  two component LuxR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 228 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3669  response regulator receiver protein  50.91 
 
 		 213 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  40.26 
 
 		 222 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0553154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  50.91 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  47.62 
 
 		 864 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0920  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 225 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491034  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4820  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 218 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.67 
 
 		 224 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>