104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4901 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4901  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 161 aa  323  6e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4636  transcriptional regulator, LuxR family  36.45 
 
 		 320 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701031  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 394 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 395 aa  50.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 405 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2824  transcriptional regulator, LuxR response regulator receiver  35.23 
 
 		 209 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  50.98 
 
 		 395 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 258 aa  47.4  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2730  response regulator receiver  34.43 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.776601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 223 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0836  LuxR family two component transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0588074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0852  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  0.596615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0920  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491034  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 383 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4565  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 228 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 227 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1159  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 209 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.942847  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0273  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 231 aa  44.7  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3664  regulatory protein, LuxR  42.31 
 
 		 215 aa  44.7  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0795  regulatory protein LuxR  32.47 
 
 		 202 aa  44.7  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000492678  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 947 aa  44.3  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0699  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 200 aa  44.3  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  34.09 
 
 		 215 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  34.09 
 
 		 215 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2809  regulatory protein, LuxR  36.84 
 
 		 286 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3005  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00815247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 913 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  34.09 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  34.09 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  34.09 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.53 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000464283  hitchhiker  0.00000781977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 919 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  47.92 
 
 		 680 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3420  LuxR family DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.9 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  44.9 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 840 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0792  two component LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000151034  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  35.23 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2275  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0694  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 252 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.770061  normal  0.351457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161759  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00157  transcriptional regulator LuxR  41.51 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3836  two component LuxR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000136397  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  33.72 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0722  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.511528  normal  0.608348 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.11 
 
 		 258 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002211  transcriptional regulator LuxR family  41.51 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  34.19 
 
 		 903 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  33.72 
 
 		 215 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.72 
 
 		 215 aa  42.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  44.9 
 
 		 216 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 391 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 222 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 216 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 1137 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4059  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 212 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  33.72 
 
 		 215 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  33.72 
 
 		 215 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1533  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.717435  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  33.72 
 
 		 215 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  33.72 
 
 		 215 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  33.72 
 
 		 215 aa  42.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  33.72 
 
 		 215 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0331  LuxR family DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 213 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338839  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2822  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 211 aa  42  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 216 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2440  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 220 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119534  normal  0.0380024 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0657  two component LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 209 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493749  normal  0.229808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3365  two component LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 209 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0656  two component LuxR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 209 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000830399  normal  0.140804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  45.28 
 
 		 955 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1536  LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 357 aa  41.2  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.413488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  46.94 
 
 		 981 aa  41.2  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_004310  BR0315  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 213 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  32.88 
 
 		 209 aa  41.2  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 995 aa  41.2  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2614  two component LuxR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 222 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  34.29 
 
 		 218 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  42.86 
 
 		 960 aa  40.8  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 221 aa  40.8  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1828  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  38.89 
 
 		 216 aa  40.8  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 215 aa  40.8  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0757  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 210 aa  40.8  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0625  two component LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 221 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793996  hitchhiker  0.00440064 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0261  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 210 aa  40.8  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.574059  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1543  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.62 
 
 		 221 aa  40.8  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0272  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.71 
 
 		 218 aa  40.8  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.353555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1027  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 222 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0618  LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 215 aa  40.8  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0290  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 210 aa  40.8  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 215 aa  40.8  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 918 aa  40.8  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 947 aa  40.8  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.92 
 
 		 218 aa  40.8  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>