137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2670 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2670  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 430 aa  841    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0622  response regulator receiver protein  38.36 
 
 		 427 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00153104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0435  transcriptional regulator, LuxR family  24.9 
 
 		 470 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000202079 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13460  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  27.97 
 
 		 472 aa  57  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22730  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  24.1 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  31.07 
 
 		 191 aa  54.7  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2754  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 215 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2846  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 215 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.243379  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2938  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 215 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2743  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 215 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 501 aa  53.1  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3765  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 277 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1903  transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 196 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000231921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 245 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02940  putative LuxR-family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 198 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.86 
 
 		 223 aa  51.2  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.253855  normal  0.0592312 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0181  transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 600 aa  51.2  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00480  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.51 
 
 		 606 aa  50.4  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00118843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0405  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06810  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42 
 
 		 520 aa  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0461  transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 542 aa  50.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3393  transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 201 aa  49.7  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.269822  hitchhiker  0.000260191 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.81 
 
 		 216 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  33.8 
 
 		 824 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 232 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2812  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 522 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000674561  hitchhiker  0.0000653029 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2048  transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 197 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0074  response regulator receiver protein  50 
 
 		 207 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13370  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  37.5 
 
 		 537 aa  48.5  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.925648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0171  transcriptional regulator, LuxR family  22.91 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2688  transcriptional regulator, LuxR family  27.5 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0421  transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 552 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0413788  hitchhiker  0.00000000225621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 234 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 226 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.33 
 
 		 536 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0406  transcriptional regulator, LuxR family  32.29 
 
 		 486 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0269651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 220 aa  47.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0269  transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 499 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1592  transcriptional regulator, LuxR family  27.17 
 
 		 518 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.19 
 
 		 880 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 209 aa  47.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  40.74 
 
 		 207 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  37.25 
 
 		 221 aa  47  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 275 aa  47  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1181  response regulator, positive activator of uhpT transcription  35.82 
 
 		 318 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041551  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 246 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16610  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  24.71 
 
 		 491 aa  47  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0119595  normal  0.714327 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1837  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 487 aa  47  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  41.07 
 
 		 213 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 192 aa  46.6  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1236  two component LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 208 aa  46.6  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.23752  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  30.65 
 
 		 214 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0531  transcriptional regulator, LuxR family  26.13 
 
 		 529 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.614613  normal  0.848046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.58 
 
 		 230 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4160  two component transcriptional regulator, LuxR family  38 
 
 		 215 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0201669  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.87 
 
 		 947 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4633  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 273 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2047  LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 301 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.909025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 994 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4009  LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 288 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  38 
 
 		 220 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17340  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  37.74 
 
 		 232 aa  45.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.59 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.245465  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.21 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03730  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  28.72 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.532687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.36 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0175254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0436  transcriptional regulator, LuxR family  27.3 
 
 		 501 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1015  transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.221092  normal  0.129145 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0500  transcriptional regulator, LuxR family  22.64 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.472786 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2644  response regulator receiver domain-containing protein  37.29 
 
 		 235 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 237 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0602  transcriptional regulator, LuxR family protein  34.62 
 
 		 210 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  37.04 
 
 		 879 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 213 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  36.54 
 
 		 893 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2409  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.82 
 
 		 221 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000055116  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3717  LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.314676 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2791  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  38.46 
 
 		 893 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2723  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 509 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.397924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0506  transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 519 aa  44.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  29.11 
 
 		 960 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.1 
 
 		 925 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 208 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  44.3  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2925  transcriptional regulator, LuxR family  29.7 
 
 		 517 aa  43.9  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2190  LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 298 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2873  LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 282 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3106  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 239 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2357  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.56 
 
 		 234 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05580  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.19 
 
 		 512 aa  44.3  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.735856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23170  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.33 
 
 		 474 aa  43.9  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.23412 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13550  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  36.23 
 
 		 506 aa  44.3  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2786  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 511 aa  44.3  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0490323 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>