More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0435 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0435  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
470 aa  939    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000202079 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2358  regulatory protein, LuxR  55.53 
 
 
483 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2670  LuxR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
430 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.24 
 
 
228 aa  57.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
232 aa  56.6  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 
929 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 
963 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 
204 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 
160 aa  53.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
225 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1181  response regulator, positive activator of uhpT transcription  43.86 
 
 
318 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000041551  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  48 
 
 
204 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26890  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  26.21 
 
 
515 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  38.16 
 
 
225 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40 
 
 
981 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0757  LuxR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
210 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  38.36 
 
 
231 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0475  regulatory protein LuxR  41.54 
 
 
271 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  27.96 
 
 
320 aa  51.6  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2348  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
219 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
223 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0683  two component LuxR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
209 aa  51.2  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000388278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3836  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
209 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000136397  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0792  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
209 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000151034  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0653  LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
206 aa  50.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.203226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
209 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161759  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 
209 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000464283  hitchhiker  0.00000781977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  33.75 
 
 
418 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
210 aa  50.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4359  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 
302 aa  50.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  35.37 
 
 
191 aa  50.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0602  transcriptional regulator, LuxR family protein  44.23 
 
 
210 aa  50.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126322  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34130  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.31 
 
 
853 aa  50.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  43.33 
 
 
977 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.31 
 
 
881 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2290  transcriptional regulator, LuxR family  31.17 
 
 
493 aa  50.4  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10968  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0615  transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 
462 aa  50.1  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000110739  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 
222 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  32.58 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 
901 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  42.86 
 
 
209 aa  49.7  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 
981 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
232 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.173401  normal  0.808062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  37.7 
 
 
758 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 
363 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  36.51 
 
 
209 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1613  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 
126 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0395666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3767  regulatory protein, LuxR  46.43 
 
 
89 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.163758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 
250 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0657  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
209 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493749  normal  0.229808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3365  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
209 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0656  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
209 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000830399  normal  0.140804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
209 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
217 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 
235 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  36.84 
 
 
376 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
471 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 
217 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 
188 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 
211 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.00104431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0857  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 
219 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
454 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1698  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 
207 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0465  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 
239 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0157  transcriptional regulator, LuxR family  32.91 
 
 
321 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3373  LysR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
227 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 
260 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 
229 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3294  LysR-family transcriptional regulator  42.59 
 
 
248 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42203  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3299  LysR-family transcriptional regulator  42.59 
 
 
227 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212015  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  38.98 
 
 
209 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3468  LysR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
248 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0530935  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 
680 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 
501 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3366  LysR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
227 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.857101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0250  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.8 
 
 
260 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.664516  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  43.75 
 
 
217 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3999  transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 
260 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000000117104  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
214 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  38.36 
 
 
913 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2151  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
264 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3710  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
426 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
214 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 
215 aa  48.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
214 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0167  transcriptional regulator, LuxR family  28.38 
 
 
493 aa  47.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.165739  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
950 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2816  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 
471 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  hitchhiker  0.00338242 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
237 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0280  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.76 
 
 
245 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
368 aa  47.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 
218 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4682  putative PAS/PAC sensor protein  42.11 
 
 
192 aa  47.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.706561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 
550 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12490  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.34 
 
 
560 aa  47.4  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 
209 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 
258 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
191 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.78 
 
 
243 aa  47.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  35.09 
 
 
356 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>