More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2791 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2791  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1916  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000562925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1912  LuxR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0870  transcriptional regulator, LuxR family  36.24 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0341  LuxR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  31.54 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  44.26 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0710  two component LuxR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  42.65 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 253 aa  57.8  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 216 aa  57  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  37.35 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  37.35 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.45 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3393  transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.269822  hitchhiker  0.000260191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 303 aa  55.5  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  50 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4341  two component LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 343 aa  55.1  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  46.27 
 
 		 541 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.7 
 
 		 913 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 491 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2061  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.81 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 213 aa  54.3  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  29.08 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 514 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 510 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 510 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 352 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5154  LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 510 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.41 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.26 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  45.61 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.46 
 
 		 914 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0365  two component LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.210231  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 250 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 246 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 226 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 496 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1059  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.84 
 
 		 221 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 496 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 514 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 214 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  26.87 
 
 		 225 aa  52  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.61 
 
 		 894 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.17 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.66 
 
 		 235 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 514 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.29 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 225 aa  52  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  48.15 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0149  DNA-binding response regulator  27.91 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1094  DNA-binding response regulator  33.11 
 
 		 279 aa  52  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000582737  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 361 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3355  two component LuxR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 232 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2604  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 74 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4822  two component LuxR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 223 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5522  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  44.44 
 
 		 896 aa  51.6  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.58 
 
 		 192 aa  51.2  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 225 aa  51.2  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3991  putative GAF sensor protein  39.47 
 
 		 301 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.92 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 218 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4530  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 241 aa  51.2  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 209 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0846  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 74 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 220 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>