More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1059 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1059  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1656  two component LuxR family transcriptional regulator  77.62 
 
 		 224 aa  351  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1863  LuxR family DNA-binding response regulator  77.14 
 
 		 218 aa  349  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.345514  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3538  DNA-binding response regulator, LuxR family  77.14 
 
 		 223 aa  349  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1913  DNA-binding response regulator, LuxR family  77.14 
 
 		 212 aa  349  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.605645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1802  DNA-binding response regulator, LuxR family  77.14 
 
 		 229 aa  349  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1659  LuxR family DNA-binding response regulator  76.67 
 
 		 212 aa  346  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1791  LuxR family DNA-binding response regulator  76.67 
 
 		 212 aa  346  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.276817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1637  response regulator  75.71 
 
 		 212 aa  343  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000588398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1839  DNA-binding response regulator, LuxR family  75.71 
 
 		 212 aa  342  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1606  response regulator  75.71 
 
 		 212 aa  341  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0080  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.57 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.65 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.61 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.55 
 
 		 233 aa  161  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.35 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0149  DNA-binding response regulator  43 
 
 		 201 aa  158  7e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 226 aa  158  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.93 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.39 
 
 		 211 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2324  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.02 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5550  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159917  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  40.28 
 
 		 221 aa  155  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 239 aa  154  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  37.85 
 
 		 234 aa  154  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.17 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.35 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 225 aa  154  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 213 aa  154  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2689  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  0.346923 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.85 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.83 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05830  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.1 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.388223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  40.3 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.71 
 
 		 242 aa  151  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  39 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  36.79 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 216 aa  151  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4511  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.76 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.93 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5619  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.61 
 
 		 236 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  37.56 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  37.02 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.99 
 
 		 232 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7377  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  38.5 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.7 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.79 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  38.86 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  38.5 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.89 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2518  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.43 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.41 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4366  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.74 
 
 		 225 aa  148  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 215 aa  148  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.28 
 
 		 231 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 219 aa  147  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.67 
 
 		 247 aa  147  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  39.13 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  39.13 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  39.13 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  36.36 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  38.73 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  40.67 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1240  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>