More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1403 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1403  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  523  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02316  transcription regulator protein  31.94 
 
 		 227 aa  95.5  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.499262 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1926  hypothetical protein  27.71 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 788 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0277  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 833 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0620  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 843 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10344  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 832 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0443  LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 845 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0453  LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 845 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00902802  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0430  LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 845 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.32699  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2317  hypothetical protein  31.82 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1927  hypothetical protein  44.44 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3086  transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 695 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1516  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 182 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300196  normal  0.667528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.87 
 
 		 836 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.95 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.86 
 
 		 215 aa  53.5  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 213 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3273  LuxR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 185 aa  52.4  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2098  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  52  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8799  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4476  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  51.92 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0788  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  25.13 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  25.13 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  25.13 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  25.13 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22220  Transcriptional regulator, LuxR family  32.88 
 
 		 188 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 522 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 910 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  25.13 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  25.13 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  25.13 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0949  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 181 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.359362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1109  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 181 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0705073  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1876  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 181 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402354  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2609  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 181 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3263  transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 188 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1551  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 181 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1723  sensory box transcriptional regulator  40.35 
 
 		 181 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0473  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 488 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0214  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 181 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1698  PAS  40.35 
 
 		 181 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361141  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1761  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 181 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 240 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1960  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 181 aa  49.7  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 952 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1564  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 181 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  24.62 
 
 		 239 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 952 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  38.1 
 
 		 217 aa  49.7  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 956 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3219  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.62 
 
 		 208 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 222 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04820  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.15 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1785  LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 228 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1654  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 181 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00914552  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1984  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 181 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.94 
 
 		 217 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 755 aa  48.5  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 239 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 239 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 239 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1062  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 876 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3748  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.97 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>