More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0430 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10344  transcriptional regulator  59.86 
 
 
832 aa  808    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0443  LuxR family transcriptional regulator  98.58 
 
 
845 aa  1581    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0453  LuxR family transcriptional regulator  98.58 
 
 
845 aa  1581    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00902802  normal  0.164527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0620  response regulator receiver protein  69.89 
 
 
843 aa  1005    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0430  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
845 aa  1608    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.32699  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0277  response regulator receiver protein  67.54 
 
 
833 aa  906    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.87 
 
 
836 aa  292  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  33.99 
 
 
788 aa  276  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3086  transcriptional regulator, LuxR family  36.85 
 
 
695 aa  261  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1635  LuxR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
818 aa  173  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1650  regulatory protein, LuxR  36.95 
 
 
794 aa  169  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315022  normal  0.343942 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
215 aa  58.9  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 
218 aa  58.9  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
814 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  39.44 
 
 
900 aa  58.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 
210 aa  58.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1403  hypothetical protein  40.68 
 
 
252 aa  56.6  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 
959 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4906  response regulator receiver  41.76 
 
 
205 aa  57  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275081  normal  0.875639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 
755 aa  56.2  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  49.12 
 
 
937 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
919 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 
203 aa  56.2  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  44.78 
 
 
919 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  44.78 
 
 
919 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1255  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.94 
 
 
219 aa  55.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.490147  normal  0.40644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 
228 aa  55.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  50 
 
 
228 aa  55.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  40.28 
 
 
212 aa  55.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2543  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 
217 aa  55.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473476  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  45.76 
 
 
855 aa  55.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  40.28 
 
 
212 aa  54.7  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 
876 aa  54.7  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 
550 aa  54.3  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 
241 aa  54.3  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0710  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 
226 aa  54.3  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.614335  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
248 aa  54.3  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 
211 aa  54.3  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 
217 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 
222 aa  53.9  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0656  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 
218 aa  53.5  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.214241 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  46.15 
 
 
231 aa  53.9  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 
232 aa  54.3  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0277  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 
228 aa  53.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.0298075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28320  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.08 
 
 
220 aa  53.5  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  49.02 
 
 
963 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  38.89 
 
 
233 aa  53.5  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
947 aa  53.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  46.15 
 
 
229 aa  53.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  47.17 
 
 
919 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
1030 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  49.02 
 
 
929 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  37.78 
 
 
910 aa  52.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3894  response regulator receiver protein  42.65 
 
 
208 aa  52.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.52621  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17340  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  48.08 
 
 
232 aa  52.8  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.15 
 
 
907 aa  52.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 
973 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  39.78 
 
 
864 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  36.92 
 
 
893 aa  52  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 
226 aa  52.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  35.63 
 
 
1052 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  32.93 
 
 
894 aa  52.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  51.79 
 
 
799 aa  51.6  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
215 aa  52  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4026  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
200 aa  52  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  45.1 
 
 
977 aa  52  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  50 
 
 
916 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.78 
 
 
214 aa  51.6  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5726  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 
228 aa  51.2  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451347  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0846  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
209 aa  51.2  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.06 
 
 
862 aa  51.2  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33440  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.45 
 
 
938 aa  51.2  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  30.53 
 
 
998 aa  51.2  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 
943 aa  51.2  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  40.26 
 
 
981 aa  50.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  36.27 
 
 
217 aa  50.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0642  putative response regulator  35.87 
 
 
217 aa  50.4  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  41.94 
 
 
936 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2998  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
228 aa  50.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 
218 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  45.16 
 
 
574 aa  50.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 
905 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.05 
 
 
215 aa  50.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
205 aa  50.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 
1089 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  40.26 
 
 
214 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5233  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 
223 aa  50.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114456  hitchhiker  0.000738291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 
556 aa  50.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
201 aa  49.7  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3239  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
274 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 
872 aa  50.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 
913 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
889 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  42.86 
 
 
210 aa  49.7  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 
960 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  46.03 
 
 
567 aa  49.7  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
881 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
876 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6883  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.69 
 
 
213 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239531  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  44.93 
 
 
983 aa  50.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>