More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02316 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02316  transcription regulator protein  100 
 
 		 227 aa  478  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.499262 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1403  hypothetical protein  31.94 
 
 		 252 aa  95.5  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1926  hypothetical protein  31.45 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2348  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0559  transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 788 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0758  transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0562  two component LuxR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 297 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3263  transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1761  transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22220  Transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1960  LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3128  LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.26 
 
 		 836 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2173  LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0697  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 70 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.273428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1455  LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 197 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231735  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.38 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.37 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2463  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 423 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1888  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 212 aa  52  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  32.32 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1121  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.864132  normal  0.872256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 775 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4688  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.76 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  26.26 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1927  hypothetical protein  42.86 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  26.26 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2636  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3585  two component LuxR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.295986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 882 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 1089 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  38.71 
 
 		 919 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  33.73 
 
 		 839 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  35.53 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 261 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4267  LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 180 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0846  transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 74 aa  48.5  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 339 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2294  transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0277  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 833 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2659  putative PAS/PAC sensor protein  41.18 
 
 		 184 aa  48.5  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00996  response regulator  33.71 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0885199  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06170  response regulator  33.71 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.624626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3205  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 74 aa  48.5  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.826126  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  41.27 
 
 		 231 aa  48.5  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2402  LuxR family DNA-binding response regulator  37.68 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 206 aa  48.5  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3147  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.27 
 
 		 302 aa  48.5  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0642  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 208 aa  48.5  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1688  LuxR family DNA-binding response regulator  37.68 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000202542  normal  0.0533619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2499  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449467  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4629  germination protein GerE  45.76 
 
 		 74 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 1085 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4385  germination protein GerE  45.76 
 
 		 74 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4226  germination protein  45.76 
 
 		 74 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4238  germination protein  45.76 
 
 		 74 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1109  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0705073  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1551  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2635  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.76 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000528497  hitchhiker  0.00476816 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1785  LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 887 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 927 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1876  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1698  PAS  41.38 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0626  germination protein GerE  45.76 
 
 		 74 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.41 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1564  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.1 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4724  germination protein GerE  45.76 
 
 		 74 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.105908  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1723  sensory box transcriptional regulator  41.38 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2609  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0949  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.359362  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0214  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4329  LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 74 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 919 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0186  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4609  germination protein GerE  45.76 
 
 		 74 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4682  putative PAS/PAC sensor protein  31.9 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.706561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2058  metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 		 521 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 950 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 950 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  41.27 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2604  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 74 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>