294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2173 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2173  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1031  transcriptional regulator, LuxR family  28.09 
 
 		 439 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0038  transcriptional regulator, LuxR family  29.36 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0664  putative response regulator protein  25.81 
 
 		 508 aa  82.4  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1366  probable regulatory protein, LuxR domain protein  29.66 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0929  transcriptional regulator, LuxR family  30.28 
 
 		 498 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.661011 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3740  LuxR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3322  transcriptional regulator, LuxR family  28.78 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.304808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2244  transcriptional regulator, LuxR family  30.5 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1231  transcriptional regulator, LuxR family  29.79 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0692085  normal  0.545036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0947  two component LuxR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00385235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 921 aa  55.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2713  two component LuxR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02316  transcription regulator protein  48 
 
 		 227 aa  52.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.499262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 950 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2463  LuxR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 423 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 894 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0728  two component LuxR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 1089 aa  49.3  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15001  response regulator  37.68 
 
 		 193 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.608527  normal  0.0430708 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  46.55 
 
 		 215 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  46.55 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  46.55 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  46.55 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  46.55 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  46.55 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  46.55 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  44.9 
 
 		 940 aa  48.9  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  44.07 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  33.82 
 
 		 411 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  46.55 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 910 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 901 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 1273 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4087  LuxR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0386906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 956 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 781 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1997  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  46.67 
 
 		 197 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  43.86 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0788  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  45.45 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 919 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 214 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  25.44 
 
 		 918 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 927 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 998 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  33.75 
 
 		 947 aa  46.6  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5542  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 212 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.448293 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1884  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 199 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  28.75 
 
 		 966 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4639  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 205 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84039  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4476  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 215 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03258  two-component system regulatory protein  39.47 
 
 		 222 aa  45.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3979  two component transcriptional regulator, LuxR family  42 
 
 		 220 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.704163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 224 aa  45.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  33.82 
 
 		 976 aa  45.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0612  LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 252 aa  45.8  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17720  LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000142633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  24.48 
 
 		 421 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3523  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 224 aa  45.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  31.62 
 
 		 917 aa  45.4  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1542  putative transcriptional regulator  37.7 
 
 		 262 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.62 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2589  LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.658278  normal  0.222146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0756  LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.94 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41040  Two-component response regulator, LuxR family  46 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.136918  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3683  two component LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00690698  normal  0.306381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  45.61 
 
 		 541 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1121  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.864132  normal  0.872256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>