More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1927 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1927  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  464  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1621  LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1595  LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
254 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0092  LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1512  LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
252 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150572  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1275  transcription regulator LuxR family protein  29.65 
 
 
268 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0164  LuxR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
246 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0153554  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07094  histidine kinase  30.36 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4193  LuxR family transcriptional regulator  24.3 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001015  transcriptional regulator LuxR family  28.92 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2627  hypothetical protein  30.38 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2482  hypothetical protein  29.75 
 
 
227 aa  62.4  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0852  transcriptional regulator, LuxR family  26.07 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  33.96 
 
 
630 aa  58.5  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  33.96 
 
 
630 aa  58.5  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2744  two component LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
201 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
842 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2098  hypothetical protein  39.71 
 
 
154 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1403  hypothetical protein  44.44 
 
 
252 aa  55.1  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.06 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1926  hypothetical protein  46.43 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1954  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  28.04 
 
 
657 aa  52.8  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0244  two component system histidine kinase  28.04 
 
 
657 aa  52.8  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  32.38 
 
 
515 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0816  transcriptional regulator, LuxR family  24.67 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 
1023 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
1191 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0414  transcriptional regulator, LuxR family  24.22 
 
 
222 aa  52  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2696  transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 
535 aa  52  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 
1151 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 
1023 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02316  transcription regulator protein  42.86 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.499262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.47 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2084  LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3280  transcriptional regulator, LuxR family  23.98 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.158452  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4575  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.703378  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1713  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
361 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310925  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3838  transcriptional regulator, LuxR family  34.25 
 
 
161 aa  49.3  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.67 
 
 
239 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0243  regulatory protein LuxR  37.93 
 
 
245 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.537224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3202  transcriptional regulator, LuxR family  24.55 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  41.67 
 
 
239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 
234 aa  48.9  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  41.67 
 
 
239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 
245 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  41.67 
 
 
239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  41.67 
 
 
239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  41.67 
 
 
239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  41.67 
 
 
239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  41.67 
 
 
239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03679  transcription regulator protein  31.08 
 
 
299 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000906887  normal  0.0907157 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2929  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 
462 aa  48.5  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5323  transcriptional regulator two component heavy metal regulatory response ZniR  32.89 
 
 
206 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.844748 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 
248 aa  48.9  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
217 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  37.18 
 
 
213 aa  48.5  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
239 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
207 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0441  regulatory protein LuxR  36.67 
 
 
286 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.923746  normal  0.0183899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3321  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 
305 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.536368 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4066  transcriptional regulator LuxR family  35 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 
305 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  40.68 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2071  LuxR family regulatory protein  48.08 
 
 
73 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0680507  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4032  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.36 
 
 
1036 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 
492 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1407  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 
777 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.68 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  40.68 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  40.68 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2107  hypothetical protein  27.78 
 
 
676 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4037  putative transcriptional regulator  23.47 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.586307  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  42.11 
 
 
309 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
218 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.57 
 
 
213 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0506  transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 
519 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.274884 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  37.29 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
262 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 
233 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.81 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3499  transcriptional regulator LuxR family  36.07 
 
 
312 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.97 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2907  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0590247  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>