247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0164 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0164  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  510  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0153554  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07094  histidine kinase  64.5 
 
 		 239 aa  310  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001015  transcriptional regulator LuxR family  63.93 
 
 		 184 aa  241  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1275  transcription regulator LuxR family protein  41.85 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1595  LuxR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1512  LuxR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150572  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0092  LuxR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 267 aa  191  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1621  LuxR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1927  hypothetical protein  29.33 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0816  transcriptional regulator, LuxR family  26.32 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46850  putative transcriptional regulator  27.19 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000531033 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4193  LuxR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2098  hypothetical protein  43.66 
 
 		 154 aa  62  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0371  transcriptional regulator, LuxR family  26.92 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 683 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 		 1090 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 		 1090 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1045  transcriptional regulator, LuxR family  23.58 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 842 aa  58.9  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0852  transcriptional regulator, LuxR family  22.48 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3280  transcriptional regulator, LuxR family  24.77 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.158452  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  28.32 
 
 		 630 aa  57.8  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3202  transcriptional regulator, LuxR family  24.77 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4037  putative transcriptional regulator  25.33 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.586307  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  28.32 
 
 		 630 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2604  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 1254 aa  56.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.545668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0422  transcriptional regulator, LuxR family  25.45 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4904  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.67 
 
 		 642 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0484368  normal  0.638753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3623  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.41 
 
 		 583 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 683 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24270  PAS domain S-box/diguanylate cyclase (GGDEF) domain-containing protein  28.1 
 
 		 292 aa  52.4  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 1453 aa  52  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 1303 aa  52  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  35.45 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1954  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  27.5 
 
 		 657 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1045  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.55 
 
 		 481 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0244  two component system histidine kinase  27.5 
 
 		 657 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.47 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0414  transcriptional regulator, LuxR family  24.67 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 		 982 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0681  sensory box histidine kinase  27.15 
 
 		 356 aa  49.3  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393599  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 208 aa  49.3  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3282  LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 202 aa  48.5  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  30 
 
 		 1135 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0590  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.57 
 
 		 1144 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.851066  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 653 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0423  transcriptional regulator, LuxR family  23.56 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  32.43 
 
 		 655 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0574  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.7 
 
 		 772 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4814  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.17 
 
 		 628 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0372  putative PAS/PAC sensor protein  23.08 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2659  putative PAS/PAC sensor protein  34.29 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1343  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.69 
 
 		 859 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0844288  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  40 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1785  LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  36.76 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 		 916 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1160  putative sensor protein gacS  27.83 
 
 		 808 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5159  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.33 
 
 		 750 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0655785  normal  0.0151156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1455  LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231735  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2627  hypothetical protein  25.62 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 1047 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0982  LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1854  LuxR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 310 aa  46.2  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1464  LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 		 871 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2482  hypothetical protein  25.62 
 
 		 227 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>