More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1854 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1854  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2685  AroM family protein  31.51 
 
 		 227 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.864321  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1827  hypothetical protein  30.84 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.988892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1686  AroM family protein  30.73 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0341417  normal  0.432359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4170  AroM family protein  28.38 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000209007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0212  hypothetical protein  29.91 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3128  LuxR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 181 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4267  LuxR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 180 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3263  transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 216 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 202 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 209 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  52.54 
 
 		 209 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  52.38 
 
 		 202 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1761  transcriptional regulator, LuxR family  53.7 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1569  putative transcription regulator protein  50 
 
 		 181 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1960  LuxR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  42.17 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  52.38 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2636  LuxR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1904  LuxR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1984  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1654  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00914552  normal  0.0273292 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1717  two component LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1455  LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231735  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0704  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.96 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.753304  normal  0.399327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0376  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0164  response regulator receiver protein  54.24 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  50.85 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.74 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1152  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 181 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 210 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.79 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  51.79 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  51.79 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  45.9 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  51.79 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2659  putative PAS/PAC sensor protein  48.21 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  51.79 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.33 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  51.79 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  51.79 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  51.79 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  42.19 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  51.79 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.04 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  51.79 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.24 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3711  LuxR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 637 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.731459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0901  two component response regulator  48.39 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  33.12 
 
 		 232 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1268  LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 181 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.550511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 211 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 213 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 208 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22220  Transcriptional regulator, LuxR family  40.28 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 207 aa  57  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  50 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0514  LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  29.7 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.58 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.22 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 216 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 226 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3918  two component LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 215 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1484  response regulator  48.21 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.923295  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5156  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 208 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>