120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0852 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_0852  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 226 aa  465  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1621  LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1512  LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 252 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150572  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0092  LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1595  LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 254 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1275  transcription regulator LuxR family protein  28.04 
 
 		 268 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2098  hypothetical protein  53.42 
 
 		 154 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07094  histidine kinase  23.85 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001015  transcriptional regulator LuxR family  26.01 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1927  hypothetical protein  26.07 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0164  LuxR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0153554  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3202  transcriptional regulator, LuxR family  26.09 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3280  transcriptional regulator, LuxR family  27.18 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.158452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  41.94 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4984  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0145131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2528  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2437  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3579  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.393396  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4193  LuxR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1673  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2943  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  40 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.31 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.628591  normal  0.692285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3046  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.826568  normal  0.671191 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6057  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5557  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.92 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7055  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.92 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.657091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0279  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.16 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.79 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.75 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 881 aa  45.4  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  37.29 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1431  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 227 aa  45.1  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.338793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 233 aa  45.1  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.07 
 
 		 520 aa  45.1  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0816  transcriptional regulator, LuxR family  24.88 
 
 		 229 aa  45.1  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2627  hypothetical protein  38.16 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2482  hypothetical protein  38.16 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.8 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1045  transcriptional regulator, LuxR family  24.15 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  33.8 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  37.1 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.75 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  36.21 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1382  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0728  two component LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0376  two component LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2112  DNA-binding transcriptional activator SdiA  38.1 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.722664  hitchhiker  0.0000000000000595752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2165  DNA-binding transcriptional activator SdiA  38.1 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0921825  hitchhiker  0.00000020452 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2106  DNA-binding transcriptional activator SdiA  38.1 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1170  DNA-binding transcriptional activator SdiA  38.1 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0141324  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1293  DNA-binding transcriptional activator SdiA  38.1 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  hitchhiker  0.0000202879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4639  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84039  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  30.16 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2686  two component LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3523  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1568  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1736  DNA-binding response regulator NarL  31.75 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2764  DNA-binding response regulator NarL  31.75 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1849  DNA-binding response regulator NarL  31.75 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3072  DNA-binding response regulator NarL  31.75 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2630  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  31.75 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2686  nitrate/nitrite response regulator protein NarL  31.75 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1519  DNA-binding response regulator NarL  31.75 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.281442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2503  DNA-binding transcriptional activator SdiA  36.51 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000339648  normal  0.514976 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  37.7 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>