More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46850 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_46850  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000531033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4037  putative transcriptional regulator  83.91 
 
 		 230 aa  413  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.586307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0422  transcriptional regulator, LuxR family  25.79 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0371  transcriptional regulator, LuxR family  25.79 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0816  transcriptional regulator, LuxR family  28.37 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3202  transcriptional regulator, LuxR family  28.79 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4193  LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1045  transcriptional regulator, LuxR family  28.14 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3280  transcriptional regulator, LuxR family  25.73 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.158452  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0164  LuxR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0153554  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07094  histidine kinase  28.3 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0423  transcriptional regulator, LuxR family  25.35 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  35.94 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0372  putative PAS/PAC sensor protein  25.35 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 550 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 		 556 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 895 aa  52  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  48.08 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0414  transcriptional regulator, LuxR family  23.12 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  46.81 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  46.81 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00507176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1688  LuxR family DNA-binding response regulator  38.81 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000202542  normal  0.0533619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3404  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 427 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226025  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2402  LuxR family DNA-binding response regulator  38.81 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137953  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1621  LuxR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2499  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  50 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02400  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0092  LuxR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4514  LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333975  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0977  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00800748  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1275  transcription regulator LuxR family protein  22.71 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.41093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.9 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 1013 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  49.02 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1512  LuxR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150572  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  47.92 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2842  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 492 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.76 
 
 		 1019 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.51 
 
 		 914 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5287  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1595  LuxR family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0264  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1691  two component LuxR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 254 aa  45.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4823  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103693  normal  0.11387 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0164  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 128 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  45.83 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  45.83 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4558  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0253  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2608  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 269 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  45.83 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  45.83 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  45.83 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  30.23 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1286  two component LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  47.83 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 188 aa  45.4  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  39.58 
 
 		 228 aa  45.1  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 225 aa  45.1  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1884  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  32.89 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  41.82 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.67 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3567  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.62 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2443  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  39.62 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2539  regulatory protein, LuxR  46.67 
 
 		 904 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.50873  hitchhiker  0.00362349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>