More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0993 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  100 
 
 		 210 aa  423  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  76.19 
 
 		 210 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  76.19 
 
 		 210 aa  333  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  76.19 
 
 		 210 aa  332  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  76.19 
 
 		 210 aa  332  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  76.19 
 
 		 210 aa  332  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3078  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.86 
 
 		 210 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0577  transcriptional regulator FimZ  62.86 
 
 		 210 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0636  transcriptional regulator FimZ  62.86 
 
 		 210 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.931873  normal  0.250092 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00485  predicted DNA-binding transcriptional regulator  62.86 
 
 		 210 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0580  transcriptional regulator FimZ  62.86 
 
 		 210 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3087  transcriptional regulator FimZ  62.86 
 
 		 210 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00490  hypothetical protein  62.86 
 
 		 210 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0610  transcriptional regulator FimZ  62.86 
 
 		 210 aa  281  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0462  transcriptional regulator FimZ  62.3 
 
 		 199 aa  256  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.739138  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2160  LuxR family DNA-binding response regulator  47.34 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2269  two component LuxR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2113  LuxR family DNA-binding response regulator  46.86 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1620  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0222153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4331  two component LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.748519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5714  two component LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2114  LuxR response regulator receiver  38.16 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12780  putative two-component response regulator  37.8 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2093  putative two-component response regulator  38.97 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00430  putative two-component response regulator  39.61 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.247974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0036  putative two-component response regulator  39.61 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.035019  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4470  two component LuxR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 232 aa  147  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24710  putative two-component response regulator  38.97 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1160  putative two-component response regulator  37.8 
 
 		 209 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0174  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2101  LuxR family DNA-binding response regulator  37.38 
 
 		 207 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00862279  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3638  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 205 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.003137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1090  LuxR family DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.796271  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4334  two component LuxR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4322  two component LuxR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3974  two component LuxR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6866  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.54 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140006  normal  0.169631 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 207 aa  141  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1119  two component LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 208 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2906  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4151  DNA-binding response regulator, LuxR family  35.27 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35782  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3890  LuxR response regulator receiver  35.27 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4515  two component LuxR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5940  LuxR family response regulator  33.02 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000781929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6883  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.01 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239531  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5536  LuxR response regulator receiver  31.6 
 
 		 209 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882777  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2781  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 204 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2928  two component LuxR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0522  LuxR response regulator receiver  34.63 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000276468  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.6 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 210 aa  124  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02279  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with EvgS  32.35 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1288  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.35 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3600  DNA-binding transcriptional activator EvgA  32.35 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0441797 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02240  hypothetical protein  32.35 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2506  DNA-binding transcriptional activator EvgA  32.35 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00265649  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1300  DNA-binding transcriptional activator EvgA  32.35 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2519  DNA-binding transcriptional activator EvgA  32.35 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2655  DNA-binding transcriptional activator EvgA  32.35 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05894  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2738  DNA-binding transcriptional activator EvgA  32.35 
 
 		 204 aa  121  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2528  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.06 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  32.52 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.22 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000282  putative two-component response regulator  36.22 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1808  two component LuxR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000516369  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06590  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  32.52 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0459  two component LuxR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0590  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0603  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  31.55 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2350  two component LuxR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 244 aa  111  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1863  two component LuxR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3412  LuxR family DNA-binding response regulator  35.15 
 
 		 204 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  31.88 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.73 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  32.04 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  32.04 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  32.04 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  32.04 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  32.04 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>